Il coordinamento dell'attività didattica della SNA è affidato a 6 dipartimenti e aree didattiche e scientifiche.

• Dipartimento Management e risorse umane - DiMAR
• Dipartimento Regole e funzionamento delle pubbliche amministrazioni - DiRPA
• Dipartimento Economia e finanza - DiEF
• Dipartimento Politiche pubbliche e governance - DiPP
• Dipartimento Relazioni internazionali ed europee - DiRIE
• Dipartimento Transizioni digitale ed ecologica - DiTED

I dipartimenti, negli ambiti di rispettiva competenza e in raccordo funzionale con gli uffici, svolgono le seguenti funzioni:

• identificano i fabbisogni formativi delle Amministrazioni; 
• progettano i percorsi di formazione e individuano i relativi docenti, in      collaborazione con le aree didattiche e scientifiche coinvolte; 
• sovraintendono alla erogazione e alla valutazione delle attività formative; 
• collaborano con le aree didattico e scientifiche nella progettazione e realizzazione di attività di ricerca scientifica e di progetti europei e internazionali.